近年来的主要研究进展：1）发现并命名了4个新物种，修订了中国微型生物（有壳变形虫）分类系统；2）建立了我国第一个微型生物与泥炭地水位的转换函数模型，构建了亚洲地区大陆尺度上微型生物与水位的转换函数；3）评估了野火、土地利用和生态退化等对泥炭湿地微型生物群落结构和生物硅循环的影响；4）在湖泊环境变化研究方面，提出了富营养化、江湖阻隔和工业污染是江汉平原近百年来微型生物演替的主要驱动力；5）阐明了全球变暖背景下青藏高原地区湖泊微型生物的生态地理学分布格局和生物硅动态。  

主持国家自然科学基金项目2项，参加国家自然科学基金重点项目2项，主持教育部高等学校博士学科点专项科研基金 等10余项。主编教材1部，参编专著3部。以第一作者或通讯作者在国内外权威学术期刊发表论文40余篇，部分研究成果入选多个学术期刊封面。担任Quaternary Science Reviews, Geoderma, European Journal of Protistology, Microbial Ecology 等国际SCI权威期刊的评审人。