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非常规油气（页岩气、天然气水合物、致密油气）富集规律及评价技术；层序地层、沉积学及储层表征；地层压力预测与建模
- （26）2009-2011：中石化西北分公司“塔里木盆地中新生界碎屑岩层序地层格架与有利储集体展布及成藏条件研究”，第二专题负责。
- （25）2007-2009：中石化总公司“中扬子盆山结构复合构造系统与油气成藏改造”（YPH08002）经费1050万，第二专题负责。
- （24）2006-2008：中石油吉林油田分公司“伊通盆地构造、沉积及油气成藏综合评价”（JLYT-07-01-JS-85-1016），参加。
- （23）2007-2009：中石油大港油田分公司“歧口富油气凹陷结构构造、层序地层及沉积体系研究”（DGYT-2007-JS-5315），参加。
- （22）2008-2010：国家“十一五”科技攻关项目“琼东南盆地中央坳陷流体动力学与油气运移特征”（Z2008SLZJ-FN0175），经费100万，第二负责人。
- （2）作为科研骨干参加的科研项目
- （21）2009-2010:吉林油田分公司“伊通盆地梁家—万昌地区隐蔽油气藏分析” ，主持。
- （20）2010-2011:江汉油田研究院“潜北地区潜四下构造与沉积充填特征研究” ，主持。
- （19）2014,5-2015,5：广州海洋地质调查局：“联合勘探区块重点目标区地震解释及有利目标综合评价 ” ，主持。
- （18）2013,4-2014,4：广州海洋地质调查局：“联合勘探区块重点目标区层序地层学研究及有利目标综合评价 ”，主持。
- （17）2008-2010：国家科技重大专项“盆地深层碳酸盐岩层系油气成藏期次与盆地流体活动的耦合关系研究” ，主持。
- （16）2007－2009：国家自然科学基金项目（青年基金）“基于流体底辟构造的流体活动信息分析”（N0.40602015），主持。
- （15）2013-2015：中国地质大学（武汉）特色团队项目“莺—琼盆地温、压演化的时—空差异性及其控制因素”，主持。
- （14）2011-2013: 国家“十二五”科技攻关项目“琼东南盆地压力演化时、空差异性与成藏研究”，主持。
- ？ 油气成藏动力学及沉积学项目
- 覃硕，石万忠，王任，冯芊，一种分析石英粒内缝发育程度的方法，发明专利，201911394174.X（公示中）
- 杨洋、石万忠、王任，一种基于测井曲线的定量识别页岩岩相的方法，发明专利，201911317053.5 （公示中）
- 徐壮、石万忠，一种页岩气储层总孔隙度获取方法及装置，发明专利，2019年授权，授权号：ZL2016 1 0321166.2
- （35）王晓龙，石万忠*，何生，易智星，武子钰，徐清海，彭晓梦. 万昌地区永二段水下滑塌扇内上倾尖灭砂体识别. 地球科学—中国地质大学学报，2013, 38(3): 623-634.
- （34）王任，石万忠*，肖丹，夏飞，夏治旻，徐清海. 北黄海盆地下白垩统层序构成特点及控制因素. 石油学报，2015, 36 (12): 1531-1542
- （33）张晓明，石万忠*，徐清海，王任，徐壮，王健，王超，袁琪.四川盆地焦石坝地区页岩气储层特征及控制因素. 石油学报，2015, 36 (8): 926-939.
- （32）孔敏, 石万忠*, 宋志峰, 王晓龙. 舞阳凹陷盐岩沉积与构造的响应关系. 沉积学报, 2010, 28(2): 299-306.
- （31）宋志峰, 石万忠*, 孔敏, 王晓龙, 赵毅, 钟荣强. 三塘湖盆地马朗凹陷卡拉岗组裂缝带预测. 石油地球物理勘探，2010， 45（5）：714-719.
- （30）石万忠*，王振升，宋志峰，马建英，陆永潮，刘国全. 北大港潜山在沙三段沉积期的隆升状态及其对沉积物源的供给. 大地构造与成矿学, 2010, 34(4): 512-519.
- （29）石万忠*, 陈红汉, 何生. 库车坳陷构造挤压增压的定量评价及其超压成因. 石油学报, 2007, 28(6): 59-65.
- （28）石万忠*,孔敏,宋志峰. 伊通盆地梁家地区奢岭组混源扇三角洲内幕结构. 地球科学，2008, 33(3):365-370.
- （27）石万忠*, 宋志峰, 王晓龙, 孔敏. 珠江口盆地白云凹陷底辟构造类型及其成因. 地球科学, 2009, 34(5): 778-784
- （26）王超, 石万忠*, 张晓明,等. 页岩储层裂缝系统综合评价及其对页岩气渗流和聚集的影响. 油气地质与采收率, 2017, 24(1):50-56.
- （25）张晓明, 石万忠*, 舒志国,等. 涪陵地区页岩含气量计算模型及应用. 地球科学, 2017, 42(7):1157-1168.
- （24）徐壮, 石万忠*, 翟刚毅,等. 扬子地区下寒武统与下志留统黑色页岩孔隙度与有机碳关系差异性及原因. 地球科学, 2017, 42(7):1223-1234.
- （23）徐壮, 石万忠*, 翟刚毅,等. 涪陵地区页岩总孔隙度测井预测. 石油学报, 2017, 38(5):533-543.
- （22）王任, 石万忠*, 张先平, 等. 中国东部北黄海盆地东部坳陷岩浆活动特征及其与区域构造的耦合关系. 地球科学-中国地质大学学报, 2017, 42(4): 587-600.
- （21）石万忠*，孟福林，王晓龙，徐立涛，吴闯，王任. 松辽盆地南部孤店断陷火石岭组烃源岩的评价及预测. 石油学报，2018,39（12）：