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◆古DNA及分子演化
◆生物谱系地理
◆动植物家养驯化历史
- 更新世-全新世大熊猫种群演化历史的古基因组研究, 国家自然科学基金面上项目, No.41672017, 2017-2020
- 我国南方地区稻作起源的古DNA研究, 湖北省自然科学基金面上项目, No.2013CFB408, 2014-2015
- 我国北方地区斑鬣狗化石的古DNA分子演化研究, 国家自然科学基金青年基金项目, No. 40902008, 2010-2012
- 河北秦皇岛灵仙洞斑鬣狗化石的形态与分子演化对比研究, 中国科学院脊椎动物进化系统学重点实验室开放基金项目, No.2010LESV009, 2010-2011
- 猛犸象种内分异度研究, 生物地质与环境地质教育部重点实验室开放基金资助项目, No. BGEG0604, 2007
- 中国古人类化石及遗骸中的DNA研究, 中国地质大学(武汉)优秀青年教师基金项目, No.CUG2003049029, 2003-2005
- 我国北方地区晚更新世马化石古DNA的分子演化研究, 国家自然科学基金面上项目, No.41472014, 排名第二, 2015-2018
- 东北地区晚更新世猛犸象-披毛犀动物群分子谱系地理研究, 国家自然科学基金面上项目,No.40672006, 骨干成员, 2007-2009
- 东北地区晚更新世猛犸象-批毛犀动物群古DNA研究, 国家自然科学基金面上项目,No.40472010, 主要成员, 2006
- 第四纪化石DNA研究, 国家自然科学基金研究项目, No.40028201, 主要成员, 2002-2004
- 古、中生代之交生物多样性剧减的原因及其对现代的启示, 湖北省自然科学基金重点项目, No.2001ABB177, 主要成员, 2001-2003
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