董依然，教授、博士生导师。长期从事地质微生物、生物地球化学、及其在生态健康、环境污染治理等领域的研究，取得了一系列高质量原创性的科研成果。形成了以功能微生物为主要研究对象的多学科、多尺度、多种研究方法结合的环境微生物组研究体系。主持多向国家自然科学基金面上项目、重大研究计划培育项目，参与国家自然科学基金重点项目、重大研究计划重点项目和地质联合基金重点项目等。已在Environmental Science & Technology, Environmental Microbiology, Environmental International, Environmental International, Microbiome等环境科学和环境微生物领域经典期刊发表论文70余篇，参编专著和教材3部，引用次数3100余次，Google Scholar H指数38。目前担任Geo-Bio Interfaces主编、mLife青年编委、Frontiers in Microbiology副主编、安全与环境工程杂志编委。长期担任Science Advance,  Environmental Science & Technology, ISME Journal, Trends in Biotechnology, Environmental International, Applied and Environmental Microbiology 等30多个学术期刊的特邀审稿人。其工作成果被美国航空航天局、能源部及其他媒体专题报道，并被多个政府部门、军方工程机构、非营利组织和世界知名环境工程公司引用，作为政府技术规范、白皮书、环境工程专业人员培训教材以及军事和民用污染场地治理的理论依据。欢迎报考生物学、环境科学与工程、资源与环境等学科硕士、博士和博士后。

教育经历

2004-2009   美国俄克拉荷马大学   环境科学   博士

2001-2004   华中科技大学   环境工程   硕士

1997-2001   武汉理工大学   环境工程   本科

工作经历

2021－目前   中国地质大学环境学院生物科学与技术系，系主任

2018－目前   中国地质大学环境学院，教授

2016－2017   美国伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校，研究员                               

2009－2016   美国伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校，博士后

研究方向

• 微生物与碳达峰、碳封存

• 地下微生物组及元素循环

• 微生物-矿物相互作用

• 污染物的生物修复

• 可持续性水处理和能源生产

科研项目

主持多项中国国家自然科学基金委（NSFC）面上项目、NSFC重大研究计划培育项目，参与NSFC重大研究计划重点项目、联合项目和其他横向项目：

• NSFC地质联合基金项目（2025-2028）地下水砷富集的宏观-微观协同控制机制与人工智能识别 （课题负责人）

• NSFC面上项目（2025-2028）基于关键代谢物的候选门级辐射类群(CPR)-宿主潜在互惠共生机制研究—以叶酸为例 （主持）

• 江苏省地调院横向项目（2022-2023）江苏省海岸带生态敏感区生态地质调查（骨干成员）

• NSFC重大研究计划培育项目（2021-2023）隐秘铁循环耦合驱动硝酸盐转化的生物和非生物作用机制（主持）

• NSFC重大研究计划重点项目（2019-2022）金属还原地杆细菌到巴氏甲烷八叠球古菌种间电子直接传导的分子机理（课题负责人）

• NSFC面上项目（2019-2022）微生物异养铁还原调节地质二氧化碳封存及机理研究（主持）

• 上海海洋大学深渊科学技术研究中心开放基金（2019-2022）Microbially catalyzed iron transformation in the hadal trench ecosystems（主持）

• 武汉市科协（2019-2020）长江大保护中武汉市湖泊典范作用战略研究（骨干成员）

近5年代表作

• 代表论文（#共同第1作者、*通讯作者）

13.        Li, S., Pei, J., Fang, J., Liu, R., Wei, Y., Huang, X., Yang, G., Liu, M., Lin, Q., Sanford, R. R., Shao, H., Jiang, Y., Hu, Y., Jiang, Z., Feng, Q., He, Y., Zhang, C., Fan, Y., Dong, Y.*, Shi, L., 2026, Pressure-dependent adaptation strategies implied by the dissimilatory iron reducer Orenia metallireducens Z6, mLife, 5(1), 122-125. 

12.        He, Y., Zhuo, S., Li, M., Pan, J., Jiang, Y., Hu, Y., Sanford, A. R., Lin, Q., Sun, W., Na, W., Peng, S., Jiang, Z., Li, S., Li, Y., Dong, Y.*, Shi, L. (2025), Candidate Phyla Radiation (CPR) bacteria from hyperalkaline ecosystems provide novel insight into their symbiotic lifestyle and ecological implications, Microbiome, 13: 94.

11.       Li, S., Song, W., Liu, J. Boyanov, M. I., O’Loughlin, E. J., Kemner K. M., Sanford R. A., Shao H., Feng Q., He Y., Dong Y.*, Shi, L. (2025), Effect of CO2 concentration on the microbial activity of Orenia metallireducens (strain Z6) in surface inert materials, Minerals, 15(2), 112. 

10.       He, Y.^#, Li, Y.^#, Pan, Y., Shang, J., Sun, W., Wang, M., Fan, H., Sanford, R.A., Wei, N., Peng, S., Xie, D., Zhang, W., Chen, S., Liu, Y., Jiang, Z., Jiang, Y., Hu, Y., Li, S., Hu, N., Dong, Y.*, Shi, L. (2024), Intimate microbe-water-mineral interactions mediate alkalization in the pyroxene-rich iron ore mines in Panxi area, Southwest China, Journal of Hazardous Materials, 480, 2024, 136127.

9.       He, Y., Zhuo,  S., Gao, D., Pan, Y., Li, M., J Pan, Y Jiang, Y Hu, J Guo, Q Lin, Sanford, A. R., Sun, W., Shang, J., Li, S., Li, Y., Dong, Y.*, Shi, L. (2024), Viral communities in a pH>10 serpentinite-like environment: insight into diversity and potential roles in modulating the microbiomes by bioactive vitamin B₉ synthesis, Applied and Environmental Microbiology, e00850-24.

8.       He, Y., Pan J., Huang D., Sanford R. A., Peng, S., Wei, N., Sun, W., Shi, L., Jiang, Z., Jiang, Y., Hu, Y., Li, S., Li, Y., Li, M.*, Dong. Y.* (2023), Distinct microbial structure and metabolic potential shaped by significant environmental gradient impacted by ferrous slag weathering, Environmental International, 178, 108067.

7.       Dong, Y., Jiang, Z., Hu, Y., Jiang, Y., Tong, L., Yu, Y., Cheng, J., Shi, J., He, Y., Wang, Y.* (2023). Pathogen contamination of groundwater systems and health risks. Critical Reviews in Environmental Science and Technology, 54(4), 267–289.

6.       Dong, Y.*, Tebo, B. M.*, Editorial: Insights in Microbiological Chemistry and Geomicrobiology: 2021, 2023, Frontiers in Microbiology, 13.

5.       Li, S., Feng, Q., Liu, J., He, Y., Shi, L., Boyanov, M. I., O'Loughlin, E. J., Kemner, K. M., Sanford, R. A., Shao, H., He, X., Sheng, A., Cheng, H., Shen, C., Tu, W. and Dong, Y.* (2022). Carbonate minerals and dissimilatory iron-reducing organisms trigger synergistic abiotic and biotic chain reactions under elevated CO₂ concentration. Environmental Science & Technology, 56, 22, 16428–16440.

4.       Dong, Y.; Sanford, R. A.; Connor, L.; Chee-Sanford, J.; Wimmer, B. T.; Iranmanesh, A.; Shi, L.; Krapac, I. G.; Locke, R. A., Shao, H*. (2021). Differential structure and functional gene response to geochemistry associated with the suspended and attached shallow aquifer microbiomes from the Illinois Basin, IL. Water Research, 202: 117431.

3.       Dong, Y., Shan, Y., Xia, K., Shi, L., (2021) The proposed molecular mechanisms used by Archaea for Fe (III) reduction and Fe (II) oxidation, Frontiers in Microbiology, 1710

2.       He, Y., Huang, D., Li, S., Shi, L., Sun, W., Sanford, R. A., Fan, H., Wang, M., Li, B., Li, Y., Tang, X., Dong, Y.* (2021) Profiling of microbial communities in the sediments of Jinsha River Watershed exposed to different levels of impacts by the vanadium industry, Panzhihua, China, Microbial Ecology, 1-15.

1.    Dong, Y.*, Sanford, R. A., Boyanov, M. I., Flynn, T. M., O’Loughlin, E. J., Kemner, K. M., George, S., Fouke, K. E., Li, S., Huang, D., Li, S., Fouke, B. W. (2020) Controls on iron reduction and biomineralization over broad environmental conditions as suggested by the Firmicutes Orenia metallireducens strain Z6. Environmental Science & Technology, 54: 10128-10140.

• 参编著作

2. 董依然、李术艺、黄冬梅、胡娜，细胞和分子生物学，《地质微生物学》(第一版)，2024, 董海良、蒋宏忱主编，高等教育出版社

1.   McSweeney, C. S., Mackie, R. I.,《瘤胃微生物学》，2023，赵圣国等编译，中国农村科学技术出版社

荣誉奖项

个人奖项

• 中国地质大学2023年度先进工作者，2023

• 中国地质大学工会先进工作者，2023

• 中国地质大学环境学院2022年度先进工作者，2022

• Frontiers in Microbiology优秀副主编，2021, 2022

指导学生获得奖项和项目支持

• 中国微生物学会第十三届地质微生物学学术研讨会 优秀海报奖 (2025)（郭天赐）

• 中国微生物学会第十二届地质微生物学学术研讨会 优秀海报奖 (2024)（王鑫航）

• 中国微生物学会第25次环境微生物学学术研讨会 简浩然优秀论文 (2024)（何宇）

• 第十二届全国环境化学大会 优秀墙报奖（2023）（李晨希）

• 中国微生物学会第十一届地质微生物学学术研讨会 优秀墙报奖（2人次）（2023）（李晨希、宋文涛）

•  江苏省双碳研究生论坛 二等奖（2022）（李术艺）

• 国际生物机器人大赛（iGEM）金奖（2022）（李术艺）

• 中国微生物学会第十届地质微生物学学术研讨会 优秀海报奖（2022）(李术艺）

• 2022 拜道夫“低碳传播官”国家级优秀奖；“工科女生未来赋能计划”国家第二名；2023iGEM国际银奖；2023剑桥暑校及记录二等奖；2024联合国青年培训计划；2024年国家奖学金（张钰晨）

教学课程

• 微生物学基础（2019-2025）

• 生命科学前沿一（2019）

• 生命科学前沿二（2020）

• 现代生物学研究方法（2023， 主讲之一）

• 环境环境科学与工程前沿（2020, 2023-2025， 主讲之一）

• Professional Writing in English（2022）（留学生课程，英文）

• Introduction to Microbiology（2020，中加联合办学）（英文）

• Environmental Microbiology（2021-2025，中加联合办学）（英文）

学术兼职

• 2026-目前，Geo-Bio Interfaces 主编

• 2023-2026，Geo-Bio Interfaces 编委、副主编

• 2024-目前，mLife青年编委

• 2021-目前，生物安全与环保 副主编

• 2020-目前，Frontiers in Microbiology副主编

• 2018, 2020年，Frontiers in Microbiology特刊编辑

• 长期担任环境科学、微生物领域SCI期刊审稿编辑：Science Advance，ISME Journal, Trends in Biotechnology, Environmental Science &Technology, Geochimica et Cosmochimica Acta, Environmental Microbiology, Environmmental International, Applied and Environmental Microbiology, Journal of Hazardous Material, Applied Geochemistry,Geobiology,  FEMS Microbial Ecology等

招生和招聘

欢迎热爱科研、对环境和微生物保有好奇心的小伙伴加入我们的团队！我们热忱欢迎生物学、生态学、环境科学、环境工程及其相关背景的硕士、博士、博后的申请。联系人：董依然教授（dongyr@cug.edu.cn）。