董依然教授致力于环境生物地球化学、非典型金属代谢微生物培养和生理特性研究、地下水和土壤污染物生物修复等领域的研究，取得了一系列原创性的工作成果。形成了以功能微生物为主要研究对象的多学科、多尺度、多种研究方法结合的环境微生物组研究体系。其课题组受到国家自然科学基金面上项目、重点项目和其他项目资助。已在Environmental Science & Technology, Environmental Microbiology, ISME Journal, Applied and Environmental Microbiology，Environmental International等环境科学和环境微生物领域经典期刊发表论文70余篇，参与编写专著/教材3部，并担任mLife、Geo-Bio Interfaces、Frontiers in Microbiology、安全与环境工程杂志编委和Environmental Science & Technology, Environmental Microbiology, Applied and Environmental Microbiology, Trends in Biotechnology等20多个学术期刊的特邀审稿人。其工作成果被美国航空航天局、能源部及其他媒体专题报道，并被多个美国联邦政府部门、军方工程机构、非营利组织和世界知名环境工程公司引用，作为政府技术规范、白皮书、环境工程专业人员培训教材以及军事和民用污染场地治理的理论依据。

※ 教育经历

2004年－2009年      美国俄克拉荷马大学，环境科学，博士                             

2001年－2004年      华中科技大学，环境工程，硕士

1997年－2001年      武汉理工大学，环境工程，本科

※ 工作经历

2021年－目前           中国地质大学环境学院生物科学与技术系，系主任

2018年－目前           中国地质大学环境学院，教授

2016年－2017年      美国伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校，研究员                               

2009年－2016年      美国伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校，博士后

※ 研究方向

• 微生物与碳达峰、碳封存

• 地下微生物组（基因组、转录组、代谢组）及元素循环

• 生物地球化学机器应用

• 污染物的生物降解和代谢途径

• 持续性水处理和能源生产

※ 科研项目

负责多项中国国家自然科学基金委（NSFC）面上项目、NSFC重大研究计划培育项目，参与NSFC重大研究计划重点项目、联合项目和其他横向项目：

• 基于关键代谢物的候选门级辐射类群(CPR)-宿主潜在互惠共生机制研究—以叶酸为例 NSFC面上项目（2025-2028，主持）

• 隐秘铁循环耦合驱动硝酸盐转化的生物和非生物作用机制 NSFC重大研究计划培育项目（2021-2023，主持）

• 金属还原地杆细菌到巴氏甲烷八叠球古菌种间电子直接传导的分子机理 NSFC重大研究计划重点项目（2019-2022，参加，排名第2）

• 微生物异养铁还原调节地质二氧化碳封存及机理研究 NSFC面上项目（2019-2022，主持）

※ 近5年代表作

• 论文发表（^#共同第1作者、^*通讯作者）

12.        He, Y., Zhuo, S., Li, M., Pan, J., Jiang, Y., Hu, Y., Sanford, A. R., Lin, Q., Sun, W., Na, W., Peng, S., Jiang, Z., Li, S., Li, Y., Dong, Y.*, Shi, L. (2025), Candidate Phyla Radiation (CPR) bacteria from hyperalkaline ecosystems provide novel insight into their symbiotic lifestyle and ecological implications, Microbiome, 13: 94.

11.        Li, S., Song, W., Liu, J. Boyanov, M. I., O’Loughlin, E. J., Kemner K. M., Sanford R. A., Shao H., Feng Q., He Y., Dong Y.*, Shi, L. (2025), Effect of CO₂ concentration on the microbial activity of Orenia metallireducens (strain Z6) in surface inert materials, Minerals, 15(2), 112. 

10.       Yu He^#, Yongzhe Li^#, Yue Pan, Jianying Shang, Weimin Sun, Meng Wang, Hao Fan, Robert A. Sanford, Na Wei, Shuming Peng, Daihong Xie, Weiguang Zhang, Shulin Chen, Yong Liu, Zhou Jiang, Yongguang Jiang, Yidan Hu, Shuyi Li, Na Hu, Yiran Dong*, Liang Shi, (2024), Intimate microbe-water-mineral interactions mediate alkalization in the pyroxene-rich iron ore mines in Panxi area, Southwest China, Journal of Hazardous Materials, 480, 2024, 136127.

9.       Y He, S Zhuo, D Gao, Y Pan, M Li, J Pan, Y Jiang, Y Hu, J Guo, Q Lin, Sanford, A. R., Sun, W., Shang, J., Li, S., Li, Y., Dong, Y.*, Shi, L. (2024), Viral communities in a pH>10 serpentinite-like environment: insight into diversity and potential roles in modulating the microbiomes by bioactive vitamin B₉ synthesis, Applied and Environmental Microbiology, e00850-24

8.       He, Y., Pan J., Huang D., Sanford R. A., Peng, S., Wei, N., Sun, W., Shi, L., Jiang, Z., Jiang, Y., Hu, Y., Li, S., Li, Y., Li, M.*, D. Y.* (2023), Distinct microbial structure and metabolic potential shaped by significant environmental gradient impacted by ferrous slag weathering, Environmental International, 178, 108067.

7.       Dong, Y., Jiang, Z., Hu, Y., Jiang, Y., Tong, L., Yu, Y., Cheng, J., Shi, J., He, Y., Wang, Y.* (2023). Pathogen contamination of groundwater systems and health risks. Critical Reviews in Environmental Science and Technology, 54(4), 267–289.

6.       Dong, Y.*, Tebo, B. M.*, Editorial: Insights in Microbiological Chemistry and Geomicrobiology: 2021, 2023, Frontiers in Microbiology, 13.

5.       Li, S., Feng, Q., Liu, J., He, Y., Shi, L., Boyanov, M. I., O'Loughlin, E. J., Kemner, K. M., Sanford, R. A., Shao, H., He, X., Sheng, A., Cheng, H., Shen, C., Tu, W. and Dong, Y.* (2022). Carbonate minerals and dissimilatory iron-reducing organisms trigger synergistic abiotic and biotic chain reactions under elevated CO₂ concentration. Environmental Science & Technology, 56, 22, 16428–16440.

4.       Dong, Y.; Sanford, R. A.; Connor, L.; Chee-Sanford, J.; Wimmer, B. T.; Iranmanesh, A.; Shi, L.; Krapac, I. G.; Locke, R. A., Shao, H*. (2021). Differential structure and functional gene response to geochemistry associated with the suspended and attached shallow aquifer microbiomes from the Illinois Basin, IL. Water Research, 202: 117431.

3.       Dong, Y., Shan, Y., Xia, K., Shi, L., (2021) The proposed molecular mechanisms used by Archaea for Fe (III) reduction and Fe (II) oxidation, Frontiers in Microbiology, 1710

2.       He, Y., Huang, D., Li, S., Shi, L., Sun, W., Sanford, R. A., Fan, H., Wang, M., Li, B., Li, Y., Tang, X., Dong, Y.* (2021) Profiling of microbial communities in the sediments of Jinsha River Watershed exposed to different levels of impacts by the vanadium industry, Panzhihua, China, Microbial Ecology, 1-15.

1.    Dong, Y.*, Sanford, R. A., Boyanov, M. I., Flynn, T. M., O’Loughlin, E. J., Kemner, K. M., George, S., Fouke, K. E., Li, S., Huang, D., Li, S., Fouke, B. W. (2020) Controls on iron reduction and biomineralization over broad environmental conditions as suggested by the Firmicutes Orenia metallireducens strain Z6. Environmental Science & Technology, 54: 10128-10140.

• 参编著作

1.  C. S. McSweeney, R. I. Mackie, 《瘤胃微生物学》，2023，赵圣国等编译，中国农村科学技术出版社

2. 董依然、李术艺、黄冬梅、胡娜，第三章 细胞和分子生物学，《地质微生物学》(第一版)，2023, 董海良、蒋宏忱主编，高等教育出版社

※ 荣誉奖项

• 个人奖项

• 中国地质大学2023年度先进工作者，2023

• 中国地质大学工会先进工作者，2023

• 中国地质大学环境学院2022年度先进工作者，2022

• Frontiers in Microbiology优秀副主编，2021, 2022

• 指导学生获得奖项和项目支持

• 中国微生物学会第十二届地质微生物学学术研讨会 优秀海报奖 (2024)（王鑫航）

• 中国微生物学会第25次环境微生物学学术研讨会 简浩然优秀论文 (2024)（何宇）

• 第十二届全国环境化学大会 优秀墙报奖（2023）（李晨希）

• 中国微生物学会第十一届地质微生物学学术研讨会 优秀墙报奖（2人次）（2023）（李晨希、宋文涛）

• 江苏省双碳研究生论坛 二等奖（2022）（李术艺）

• 中国微生物学会第十届地质微生物学学术研讨会 优秀海报奖（2022）(李术艺）

• 2022拜道夫“低碳传播官”国家级优秀奖；“工科女生未来赋能计划”国家第二名；2023IGEM国际银奖；2023剑桥暑校及记录二等奖；2024联合国青年培训计划；2024年国家奖学金（张钰晨）

※ 教学课程

• 《微生物学基础》（2019-2024）

• 《生命科学前沿一》（2019）

• 《生命科学前沿二》（2020）

• 《现代生物学研究方法》（2023，主讲老师之一）

• 《环境环境科学与工程前沿》（2020, 2023, 2024，主讲老师之一）

• 《Professional Writing in English》（2022）（英文，留学生课程，主讲老师之一）

• 《Introduction to Microbiology》（2020）（英文）

• 《Environmental Microbiology》（2021-2024）（英文）

  
  

※ 学术兼职

• 2024年-目前 mLife青年编委

• 2023年-目前，Geo-Bio Interfaces 编委、副主编

• 2021年-目前，生物安全与环保 副主编

• 2020年-目前，Frontiers in Microbiology副主编

• 2018年，Frontiers in Microbiology特刊“Evidence of metabolism and metabolic potential in the terrestrial deep subsurface“客座编辑

• 长期担任环境科学、微生物领域SCI期刊审稿编辑：ISME Journal, Trends in Biotechnology, Environmental Microbiology,  Environmental Science &Technology, Applied and Environmental Microbiology, Journal of Hazardous Material, Applied Geochemistry, Geobiology, Frontier in Microbiology, FEMS Microbial Ecology, Applied Microbiology and Biotechnology, mSystem，Environmental Engineering Science，Annals of Microbiology等

※ 招生和招聘

欢迎热爱科研、对环境和微生物保有好奇心的小伙伴加入我们的团队！我们热忱欢迎生物学、生态学、环境科学、环境工程及其相关背景的硕士、博士、博后的申请。联系人：董依然教授（dongyr@cug.edu.cn）。